Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf4Q9QZS2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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