Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms