Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chaf1aQ9QWF0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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