Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Col5a3Q9JLI2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Col5a3Q9JLI2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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