Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms