Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms