Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smco4Q9JIS3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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