Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtofQ9ESF1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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