Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp29Q9ES63 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms