Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms