Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Tlr1Q9EPQ1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms