Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnft1Q9DCN7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms