Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop7Q9DCH2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop7Q9DCH2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms