Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Csnk1dQ9DC28 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Csnk1dQ9DC28 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Csnk1dQ9DC28 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1dQ9DC28 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Csnk1dQ9DC28 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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