Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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