Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn3Q9DAW9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms