Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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