Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp12Q9D9M2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms