Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms