Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms