Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn23Q9D7D7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn23Q9D7D7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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