Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nop56Q9D6Z1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms