Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms