Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stag1Q9D3E6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms