Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim42Q9D2H5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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