Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pramef12Q9D2F1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms