Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tspan11Q9D1D1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tspan11Q9D1D1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291 ms