Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc167Q9D162 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms