Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hddc3Q9D114 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hddc3Q9D114 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Hddc3Q9D114 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Hddc3Q9D114 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Hddc3Q9D114 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hddc3Q9D114 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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