Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zbed3Q9D0L1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms