Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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