Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Sgo1Q9CXH7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sgo1Q9CXH7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
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