Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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