Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RpainQ9CWY9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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