Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Cnot11Q9CWN7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cnot11Q9CWN7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cnot11Q9CWN7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cnot11Q9CWN7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cnot11Q9CWN7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cnot11Q9CWN7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cnot11Q9CWN7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cnot11Q9CWN7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot11Q9CWN7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cnot11Q9CWN7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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