Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms