Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pard3bQ9CSB4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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