Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ifitm3Q9CQW9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifitm3Q9CQW9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms