Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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