Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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