Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms