Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms