Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sf3b1Q99NB9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms