Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrabdQ99JY4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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TrabdQ99JY4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TrabdQ99JY4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TrabdQ99JY4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TrabdQ99JY4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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