Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pacsin3Q99JB8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pacsin3Q99JB8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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