Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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