Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc3Q91W40 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms