Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1aQ8VDS4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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