Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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