Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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